- 计算机科学与工程副教授
- 电话:979-845-5009
- 电子邮件:shsze@cse.tamu.edu
- 办公室:切赫427
- 网站:个人网站
教育背景
- 计算机科学博士，南加州大学，2000年
- 计算机科学硕士，宾夕法尼亚州立大学，1995年
- 香港中文大学计算机科学学士，1990年
研究兴趣
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- 生物信息学和计算生物学
- 多序列比对
- Motif发现及其在预测转录因子结合位点中的应用
- 生物网络分析
- 基因组内基因簇的鉴定
奖励与荣誉
- 本科教师教学奖:计算机科学系，2006年
选定的出版物
- 陈俊，刘勇，吕绍生，施善华。(2012)迭代展开和颜色编码:一种改进的三维匹配算法。ACM算法学报，8(6)。
- 黄永发粉丝。，Chen J. and Sze S.-H. (2012) Identifying complexes from protein interaction networks according to different types of neighborhood density. Journal of Computational Biology, 19, 1284-1294.
- 施鹏翔工程学系。，Dunham J.P., Carey B., Chang P.L., Li F., Edman R.M., Fjeldsted C., Scott M.J., Nuzhdin S.V. and Tarone A.M. (2012) A de novo transcriptome assembly of Lucilia sericata (Diptera: Calliphoridae) with predicted alternative splices, single nucleotide polymorphisms, and transcript expression estimates. Insect Molecular Biology, 21, 205-221.
- 李国强、唐崇荣、施绍华。(2012)监督蛋白质科的分类和新科的构建。计算生物学杂志，19,957-967。
- 马晓玲，郭建平，郭建平，梁玉华。、唐家辉、吴世杰、季晓霞、施善华。，Sacchettini J.C., Read L.K. and Cruz-Reyes J. (2011) Guide RNA biogenesis involves a novel RNase III family endoribonuclease in Trypanosoma brucei. RNA, 17, 1821-1830.
- 赵旭，施善华。(2011)基于跳过背景马尔可夫链中非保守位置的DNA序列Motif的发现。计算生物学杂志，18,759-770。
- 朱辉，胡峰，王荣，周晓，施善华。，Liou L.W., Barefoot A., Dickman M. and Zhang X. (2011) Arabidopsis Argonaute10 specifically sequesters miR166/165 to regulate shoot apical meristem development. Cell, 145, 242-256.
- 杨强，易刚，张峰，唐敏荣，施世华。(2010)在多个基因组的局部区域识别基因簇。计算生物学杂志，17,657-668。
- 陈俊，聂志刚，吕淑娟，Mölle陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，陈志刚，吕淑娟，Mölle。(2009)随机分治:改进的路径、匹配和填充算法。计算机学报，38,2526-2547。
- 吕颖及施善华(2009)提高基于相邻残差对齐的多序列对齐算法精度。核酸研究，37,463-472。